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自己注册公司的个体工商户，缴纳社保费用的方式一般如下。
1、准备相关材料：需要准备营业执照副本、组织机构代码证复印件、法定代表人身份证等材料。
2、开立银行账户：携带相关材料到银行开立银行账户，以便后续缴纳社保费用。
3、向社保机构申请社保账户：携带营业执照副本及法定代表人身份证等材料到社保机构申请社保账户。
4、核定社保缴纳基数：根据公司的实际情况和员工的工资水平，按照相关政策规定核定社保缴纳基数。
5、缴纳社保费用：在社保机构规定的期限内，按时缴纳相应的社保费用，可以选择现金缴纳或者网上银行缴纳等方式。
具体缴纳方式可能因地区不同而有差异，建议到当地社保部门官网查询或咨询工作人员，在缴纳社保费用时，应按时足额缴纳，避免因逾期或欠缴而产生不良影响。
仅供参考，具体流程和操作细节可能因地区和政策差异而有所不同，建议咨询当地社保部门或相关机构以获取准确信息。